Nazwa marki pochodzi od jej założyciela. Keith Bontrager był pasjonatem motocykli, a potem rowerów. Zainteresował się nimi w 1978 roku, a w 1979 zbudował swoją pierwszą szosówkę. W 1980 roku założył firmę Bontrager Cycles i wyprodukował pierwszą ramę do MTB. Wśród ciekawostek było zbudowanie przez niego kół 26” w 1984 roku. Powstawały one przez zmniejszenie (z 28” i 36 otworów) obręczy Mavica do tandemów i zrobienie z nich felg w rozmiarze 26” z 32 otworami. Wkrótce podjął współpracę z firmą Weinmann, która miała produkować dla niego obręcze, ale ostatecznie przez pożar fabryki nie doszło do tej współpracy. Postać założyciela marki uznawana jest też za jednego z ojców kolarstwa górskiego, Keith sam czynnie ścigał się w wyścigach MTB i przełajowych.
Bontrager działał na zasadach małej manufaktury, budował ramy, które miały przemyślaną i sprawdzoną w terenie konstrukcję. Keith był wierny rowerom ze stali, uważał, że to najlepszy materiał do produkcji ram. Firma działa pod jego rządami od 1980 do 1995 roku, gdy została kupiona przez Treka, a sam Keith został jej prezesem. Od tego czasu marka zaprzestała budowania ram, a skupiła się na silnym rozwoju w asortymencie komponentów - kierownic, kół, widelców itp. Obecnie Trek mocno rozwija asortyment pod brandem Bontrager. W jego skład wchodzą koła, ogumienie, komponenty rowerowe takie jak kierownice, sztyce, siodełka, mostki, ale również wszelkiej maści akcesoria rowerowe oraz odzież, obuwie i kaski.
